Adopté par le congrès académique et modifiable par un congrès, le règlement intérieur de la section académique est la règle commune du fonctionnement du S3. Dans le respect des statuts et règlementation nationaux du SNES, le RI décrit et précise les attributions et le fonctionnement des instances académiques ainsi que leurs modalités de désignation.

La version actuelle du règlement intérieur en document joint ci-dessous.